Proses rekrutmen dan seleksi pegawai pada sebuah lembaga merupakan salah satu proses penting dalam pemilihan pegawai yang dibutuhkan dalam sebuah lembaga. Ini juga dilakukan oleh Yayasan Pendidikan Cendekia Muslim pada Kamis, 16 Februari 2023. Proses seleksi  dilakukan di Kantor 1 Yayasan pendidikan Cendekia Muslim dimulai sejak pukul 09.00 WIB. Proses ini bertujuan untuk menyaring sumber daya manusia yang cocok dan sesuai dengan visi dan misi dalam lembaga. Saat calon pegawai telah dinyatakan lolos pada tahapan seleksi administrasi, maka tahapan selanjutnya adalah melakukan interview dengan HRD Rekruitmen. Hal ini biasanya akan dilakukan dengan cara memanggil calon kandidat untuk bisa hadir dan melakukan sesi wawancara.
Di Yayasan Pendidikan Cendekia Muslim ada 3 tahap penyeleksian yaitu tes komputer, tes baca al-qur’an dan interview. Interview ini dilaksanakan di kantor 1 Cendekia Muslim. Setelah tes, pelamar langsung interview bersama HRD Yayasan Pendidikan Cendekia Muslim. Mengenai pengumuman selanjutnya pihak Yayasan akan menghubungi kontak pelamar yang dinyatakan lulus seleksi.
Yayasan sendiri memiliki kategori khusus dalam menerima staff, di antaranya tidak sedang terikat kontrak di tempat lain serta bersedia bekerja dalam tim.